二战后，1945年，断瓦残垣中的日本。一场为世界所瞩目的世纪死亡审判由此拉开序幕。
美国、英国、苏联、法国、澳大利亚、荷兰、印度、菲律宾各盟国法官火速奔赴东京。由于中国在二战中受日本侵略战争中损失最为惨重，所以法官人员迟迟不能选定。焦急关头，法律奇才梅汝璈挺身而出。
《大公报》记者肖南负责报道此次审判，国愁家恨，痛在心头。日本曾是他魂牵梦绕的地方，但是战前相爱的日本同学芳子如今芳踪何处？纵使相逢，又能如何？
同为记者的芳子，在战争中失去了家宅和父母，和哥哥正夫寄居在北野雄一家中。正夫从中国服役归来，精神濒临崩溃，当他看到肖南的时候，眼里透出难以言喻的痛楚和悲哀……北野雄一和肖南因对战争的不同理解而发生冲突。
世纪审判终于开庭。首席检察官季南出场，宣读起诉书。这位“魔鬼检察官”以强悍、雷厉风行和高压态度著称。此时，战犯大川周明突然表现异样，脱光鞋袜，拖着长长的鼻涕，两只脚肆无忌惮地搓来搓去。他伸手照东条英机光头上打了一巴掌，法庭哗然。
宪兵将大川周明带出法庭时，他疯狂的高叫着“绞死东条英机！”法庭秩序大乱，接着辩护律师团副团长广濑一郎公开置疑所有法官的资格，战犯的疯狂和嚣张令法官们感到震惊。庭审在继续。所有的战犯都矢口否认自己有罪。
散庭后，芳子约肖南到家里吃饭，却在楼道见到了像野兽一样嘶吼着的北野。原来弘二已被证实死在了中国战场！性格偏狭暴躁的北野雄一遂将满腔怒火发泄在肖南身上，复仇!复仇！！二人撕打在一起……
山口正夫痛楚地看着，一言不发。国际检察局亮出了神秘王牌。前日军陆军省兵务局局长田中隆吉和清末代皇帝溥仪的相继出庭聚集了全世界的目光。皇姑屯事件、九一八事变，七七事变，一系列日本侵华事实和分裂中国的阴谋渐渐浮出水面。对于东条英机、土肥原贤二和板垣征四郎等战犯来说，庭上的每一分钟开始令他们心惊肉跳，度日如年……
南京大屠杀的审判开始了。松井石根极力狡辩、抵赖、推卸、否认。中国检查组当庭展示了搜集到的证据，一幕幕惨绝人寰的事实，一幅幅触目惊心的画面一一展现在法庭及世人面前，芳子面对这些真实证据，陷入信仰坍塌的痛苦之中……
战犯改变了策略。土肥原贤二以他多年做特务头子积累的经验,利用远东国际法庭采用英美法审判机制的漏洞,保持沉默，使得检察团及法官们无从下手。
中国检察组从国内调派首席顾问倪征燠飞赴东京。法庭上的倪征燠咄咄逼人，冷静且机智地把对手带入自己的埋伏圈，进而一步步猎杀，最终，他不但把板垣征四郎的罪行一一揭露，还将土肥原贤二的罪行也一并揭穿。
最令日本国民紧张，也令全世界兴奋的时刻到来了。对东条英机的审讯终于开始。广濑一郎气焰嚣张，检方一步步还击。东条英机使用各种方法为自己辩护，显然有备而来。季南的对策是声东击西，将矛头直接指向日本天皇。这手杀招让东条英机无法招架，为了保护自己的主子，东条英机只能不再抵赖，检方由此步步进逼，东条英机终于彻底溃败……
东条英机的失利很快传遍了日本。仇恨彻底吞噬了北野雄一，北野雄一决定杀死肖南，二人剑拔弩张，一触即发之 时，正夫开口了！原来，正夫在战争目睹了日军暴行，忍受不了北野弘二的人性泯灭，亲手杀死了满手是鲜血的弘二！肖南、芳子、北野雄一都惊呆了。已经陷于疯狂的北夜将正夫打死！芳子竭尽全力护着肖南，也被击中！北野雄一被打死。面对弥留之际的芳子，肖南终于说出了让她瞑目的话……
在量刑问题上，各国法官分歧很大，梅汝璈发表了最后的讲演，在投票决定是否执行死刑时，终于以六比五险胜。
最后的审判终于到来了，以东条英机为首的七名战犯被处以绞刑……
